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一文帶你了解基因編輯技術(shù)與動物模型構(gòu)建!

發(fā)布時間:2024-04-16
拓普生物創(chuàng)新科研服務(wù)模式圖譜——基礎(chǔ)研究培訓(xùn)、臨床研究培訓(xùn),、實驗動物技術(shù),、生物信息學(xué)相關(guān)等科研培訓(xùn)正式上線啦!

應(yīng)廣大客戶與市場亟需,,拓普生物創(chuàng)新科研服務(wù)模式圖譜——基礎(chǔ)研究培訓(xùn),、臨床研究培訓(xùn),、實驗動物技術(shù),、生物信息學(xué)相關(guān)等科研培訓(xùn)正式上線啦!歡迎各位科研錦鯉們共同學(xué)習(xí)探討~拓普生物以實驗動物技術(shù)為基點,,致力于建立以動物科研為核心的一站式服務(wù)平臺,,從理論到實操,全方位助力服務(wù)科研能力提升,!

 

課程介紹

CRISPR/Cas9 是細(xì)菌和古細(xì)菌在長期選擇壓力中形成的一種適應(yīng)性免疫防御,,可用來有效抵御病毒及外源DNA的入侵。CRISPR的Type II已經(jīng)被廣泛用于基因工程,,它包含Cas9,,crRNA和tracrRNA,其中crRNA含有能夠識別20bp的靶向互補(bǔ)序列,。Cas9,,crRNA和tracrRNA組成復(fù)合體,識別并結(jié)合crRNA互補(bǔ)的序列,,然后解開DNA雙鏈,,Cas9中的HNH活性位點剪切crRNA的互補(bǔ)DNA鏈,RuvC活性位點剪切非互補(bǔ)鏈,,最終導(dǎo)致DNA的雙鏈斷裂(DSB),,進(jìn)而實現(xiàn)基因的敲除和插入,。

 

目前,CRISPR/Cas9系統(tǒng)已經(jīng)廣泛用于對哺乳動物細(xì)胞,,細(xì)菌,,斑馬魚,小鼠,,豬,,猴的基因編輯。本學(xué)習(xí)班將詳細(xì)講解CRISPR/Cas9基因編輯工具原理,,操作流程,,理論結(jié)合實踐,將讓大家詳細(xì)了解到具體如何利用CRISPR/Cas9技術(shù)構(gòu)建基因修飾動物等,。學(xué)習(xí)班將為相關(guān)科研工作人員和興趣愛好者提供了很好的培訓(xùn)資源,。  

 

講師背景

李博士,副研究員,。2014年博士畢業(yè)于德國慕尼黑工業(yè)大學(xué)大型動物生物技術(shù)研究所, 獲極優(yōu)等榮譽(yù)學(xué)位(MAGNA CUM LAUDE),。主要研究領(lǐng)域為基因編輯動物模型構(gòu)建與應(yīng)用研究,成功構(gòu)建過ROSA26基因定點敲入大動物模型,、Kras基因點突變大動物模型,、小鼠基因編輯肝癌模型等,在基因編輯研究領(lǐng)域積累了較好的研究知識背景,,擅長對該領(lǐng)域知識講解和傳授,,講解深入淺出、邏輯性強(qiáng),,并可針對性對基因編輯實際操作問題進(jìn)行解答與啟發(fā),,以期更好地讓基因編輯工具應(yīng)用于您的工作和學(xué)習(xí)研究中。目前已發(fā)表論文22篇,,其中第一作者/并列通訊作者SCI論文12篇,,以第一發(fā)明人申請國家發(fā)明專利2項。主持完成國家自然科學(xué)基金等項目6項,,獲得上海市實驗動物學(xué)會2020年度學(xué)會工作先進(jìn)個人,、2019年 “ICLAS-CALAS國際青年獎”、2018年第三十屆上海市優(yōu)秀發(fā)明選拔賽銀獎,、2017年上海市人才發(fā)展資金等,。

 

預(yù)期目標(biāo)

1.掌握基因打靶與基因編輯技術(shù)(ZNF,TALENs,CRISPR/Cas9),能夠設(shè)計sgRNA靶點,,構(gòu)建CRISPR/Cas9質(zhì)粒,,用于基因敲除和敲入;

2.掌握CRISPR/Cas9質(zhì)粒轉(zhuǎn)染方法, 陽性細(xì)胞克隆篩選方法體系,基因編輯細(xì)胞系的建立,,基因修飾情況分析方法;

3.掌握CRISPR/Cas9脫靶產(chǎn)生的原因,,脫靶檢測方法,,降低脫靶問題的方法;

4.掌握CRISPR/Cas9的實際應(yīng)用,構(gòu)建動物模型,,對構(gòu)建基因修飾小鼠和基因修飾大動物(豬)有較深入了解;

5.掌握新基因編輯工具,,如:Cpf1, C2C2, base editing等;

6.掌握基因編輯研究領(lǐng)域前沿進(jìn)展,基因編輯工具的拓展應(yīng)用,、臨床應(yīng)用等,,形成利用基因編輯工具結(jié)合自己研究內(nèi)容等科學(xué)思維;

7.Base editor 使用方法;

8.基因編輯工具用于檢測新型冠狀病毒、基因編輯工具有可能應(yīng)用于新冠治療等應(yīng)用的介紹與拓展,。

 

課程介紹

基因編輯技術(shù)與動物模型構(gòu)建研討會日程

日期

時間

主題

詳細(xì)內(nèi)容

第一天上午

9:00-10:30

基因修飾技術(shù)簡介(一)

基因打靶與基因編輯技術(shù)(ZNF, TALENs,,CRISPR/Cas9)介紹

基因編輯、基因修飾,、基因打靶,、轉(zhuǎn)基因、基因敲除,、基因敲入等專業(yè)領(lǐng)域概念梳理

CRISPR/Cas9結(jié)構(gòu)和特點

如何使用CRISPR/Cas9系統(tǒng)對特定基因進(jìn)行敲除或定點插入(詳細(xì)方法步驟)



拓展如何提高定點敲入效率等知識

10:30-10:45

休息

10:45-12:00

基因修飾技術(shù)簡介(二)

基因編輯工具Cas12(Cpf1),、Cas13(C2C2)、Cas14的結(jié)構(gòu),、特點,、工作原理

如何使用Cas12(Cpf1)、Cas13(C2C2),、Cas14系統(tǒng)進(jìn)行編輯

Cas12(Cpf1),、Cas13(C2C2)、Cas14與Cas9的比較

Cas9,、Cas12(Cpf1),、Cas13(C2C2),、Cas14的應(yīng)用和技術(shù)展望

上午現(xiàn)場答疑


12:00-13:30

午飯及午休

第一天下午

13:30-14:00

CRISPR(sgRNA)設(shè)計方法和相關(guān)網(wǎng)站介紹

sgRNA設(shè)計方法和相關(guān)網(wǎng)站介紹

CRISPR(sgRNA)的在線設(shè)計(在線互動設(shè)計演練)

14:00-15:30

基因編輯實驗詳細(xì)操作

gRNA    oligos模板退火

退火gRNA與線性化CRISPR/Cas9載體連接

連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到大腸桿菌(DH5α),,轉(zhuǎn)化產(chǎn)物涂板培養(yǎng),CRISPR/Cas9重組子細(xì)菌克隆挑取,,擴(kuò)大化培養(yǎng),,鑒定陽性克隆

細(xì)胞轉(zhuǎn)染(Electroperation,Nuclefection,,Nanofection,,X-fection)等介紹與應(yīng)用拓展

單細(xì)胞克隆篩選(有限稀釋法,濾紙法,、環(huán)法,、流式分選法等)方法介紹與應(yīng)用拓展

15:30-15:45



15:45-17:00

利用CRISPR/Cas9技術(shù)編輯動物細(xì)胞系

CRISPR/Cas9質(zhì)粒細(xì)胞轉(zhuǎn)染方法

陽性細(xì)胞克隆篩選,基因修飾基因組DNA模板快速制備

目的靶基因的基因組DNA片段的PCR擴(kuò)增,,電泳檢測PCR產(chǎn)物

PCR產(chǎn)物退火變性,,T7E1酶切,,電泳鑒定基因修飾情況

17:00-17:30

CRISPR/Cas9關(guān)鍵點總結(jié)、歸納,、拓展

基因編輯關(guān)鍵知識點歸納,、總結(jié)和提煉

CRISPR/Cas9技術(shù)應(yīng)用拓展(如CAB基因敲入方法等介紹)


第二天上午

9:00-10:30

利用基因編輯技術(shù)構(gòu)建基因敲除或敲入小鼠

基因工程小鼠的詳細(xì)分類與比較

小鼠受精卵分離和培養(yǎng)

CRISPR/Cas9系統(tǒng)顯微注射到小鼠受精卵

受精卵顯微注射后回輸?shù)酱心甘篌w內(nèi)

PCR和T7E1分析和鑒定基因敲除小鼠(Founder)

基因敲除小鼠基因敲除情況分析

CRISPR/Cas9構(gòu)建基因敲除小鼠詳細(xì)實驗流程歸納和總結(jié)

10:30-10:45

休息

10:45-11:15

利用基因編輯技術(shù)構(gòu)建大動物模型

以大動物豬為例,進(jìn)行詳細(xì)介紹基因編輯技術(shù)在大動物模型中的應(yīng)用

利用CRISPR/Cas9構(gòu)建基因修飾大型動物(豬)流程

基因修飾大型動物優(yōu)勢

利用CRISPR/Cas9構(gòu)建基因修飾大動物(豬)模型介紹

11:15-12:00

利用基因編輯技術(shù)構(gòu)建動物模型的詳細(xì)案例介紹

利用CRISPR/Cas9構(gòu)建基因修飾小鼠方法與相關(guān)基因修飾小鼠模型

利用CRISPR/Cas9構(gòu)建基因修飾大動物(豬,、猴)方法與相關(guān)基因修飾大動物模型

拓展基因編輯技術(shù)在其它物種中的應(yīng)用

拓展基因編輯技術(shù)在其它物種中的應(yīng)用


12:00-13:30

午飯及午休

第二天下午

13:30-15:00

實驗結(jié)果的點評與討論

CRISPR/Cas9載體構(gòu)建討論

目的靶基因的基因組DNA片段的PCR擴(kuò)增,,電泳檢測PCR產(chǎn)物結(jié)果討論

PCR產(chǎn)物T7E1酶切,電泳鑒定基因修飾情況結(jié)果討論

Sanger測序鑒定基因編輯結(jié)果:CRISPR/Cas9質(zhì)粒陽性轉(zhuǎn)化子測序結(jié)果確認(rèn),;Sanger測序閱讀基因編輯情況,;如何從測序色譜圖中閱讀靶向突變等位基因型

15:00-15:30

CRISPR/Cas9脫靶問題分析

脫靶產(chǎn)生的原因

脫靶檢測方法

降低脫靶問題的方法

15:30-15:45


15:45-16:30

基因編輯領(lǐng)域進(jìn)展大梳理與全面拓展

基因編輯技術(shù)的應(yīng)用拓展介紹:SHERLOCK-V1、SHERLOCK-V2等應(yīng)用于檢測方面的拓展,,Base editing

結(jié)合當(dāng)下新型冠狀病毒熱點,,基因編輯工具用于檢測新型冠狀病毒、基因編輯工具有可能應(yīng)用于新冠治療等應(yīng)用的介紹與拓展

Cas系列突變體的介紹與應(yīng)用

基因編輯的拓展應(yīng)用(如應(yīng)用于杜氏營養(yǎng)肌不良綜合征,、白內(nèi)障,、消滅蚊子、植物中的應(yīng)用,、細(xì)菌中的應(yīng)用等)

基因編輯工具的倫理問題于討論

 

收費標(biāo)準(zhǔn)

會務(wù)費用:線上:2800元/人      

會議時間:2022年3月12-13日

會議地點:線上:騰訊會議網(wǎng)絡(luò)會議室

 

咨詢及報名方式

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