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一文讀懂彗星實(shí)驗(yàn)

發(fā)布時(shí)間:2024-04-16
自然界中有很多因素引起DNA損傷,物理因素如冷凍、放射性照射等,;化學(xué)因素包括有機(jī)和無(wú)機(jī)化合物,,如過(guò)氧化物,、各種致癌物等,;生物因素包括年齡、生活習(xí)慣等等,。但凡能夠引起真核細(xì)胞DNA損傷的,,都能夠用細(xì)胞彗星實(shí)驗(yàn)來(lái)研究DNA損傷程度,。

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1:DNA損傷示例圖(圖片來(lái)自網(wǎng)絡(luò))

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彗星實(shí)驗(yàn)(Comet assay)也被稱(chēng)為單細(xì)胞凝膠電泳實(shí)驗(yàn)(Single cell gel electrophoresis,SCGE),,是一種在單細(xì)胞水平上檢測(cè)DNA損傷的技術(shù),。

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 真核細(xì)胞DNA分子量大,以超螺旋結(jié)構(gòu)存在于細(xì)胞核中,。用瓊脂糖凝膠將細(xì)胞包埋后,,在細(xì)胞裂解液中,細(xì)胞膜,、核膜等生物膜結(jié)構(gòu)被破壞,,細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、RNA及其他成分進(jìn)入凝膠中,,然后擴(kuò)散到裂解液中,。但核內(nèi)的DNA仍然纏繞在核骨架上并留在原來(lái)的位置。在堿性電泳液中(PH>13,DNA雙鏈解螺旋,,且變性為單鏈。電泳中,,如果DNA沒(méi)有損傷,,則將停留在原位,,染色后呈圓形的熒光團(tuán),,無(wú)拖尾出現(xiàn)。如果DNA受損,,斷裂的碎片進(jìn)入到凝膠中,,在電場(chǎng)的作用下,DNA碎片離開(kāi)原位向陽(yáng)極遷移,,形成拖尾,。DNA受損越嚴(yán)重,斷裂越多,,產(chǎn)生的碎片就越多,、越小,則向陽(yáng)極遷移的DNA碎片量就越多,,遷移距離也越長(zhǎng),,熒光染色后就能看見(jiàn)彗星樣尾長(zhǎng)并且熒光強(qiáng)度增強(qiáng)(彗星樣細(xì)胞示意圖如圖2)。通過(guò)相應(yīng)軟件分析如出現(xiàn)的彗尾長(zhǎng)度,、彗尾熒光強(qiáng)度等就可以得到該細(xì)胞DNA損傷程度,。

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2:彗星樣細(xì)胞示意圖

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各實(shí)驗(yàn)室彗星實(shí)驗(yàn)步驟略有不同,本公司所用步驟如圖3,。


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3:彗星實(shí)驗(yàn)步驟

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 彗星實(shí)驗(yàn)染色后拍照,,如果DNA沒(méi)有損傷則會(huì)看見(jiàn)圓的熒光團(tuán),沒(méi)有拖尾,;如果DNA有損傷,,則會(huì)看見(jiàn)如圖4所示的彗星樣的拖尾。

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4:彗星實(shí)驗(yàn)染色后拍照

       

在拍照時(shí)以tif格式保存圖片,,然后用CASP彗星分析軟件分析,。常用的指標(biāo)包括:尾部DNA百分?jǐn)?shù)、尾長(zhǎng),、彗星長(zhǎng),、尾矩、Olive尾矩等,,如圖5,。 

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5:彗星實(shí)驗(yàn)結(jié)果統(tǒng)計(jì)

此外,根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求,,和對(duì)照組比較還能得到彗星樣細(xì)胞形成率或稱(chēng)細(xì)胞彗星率,。如果用不同藥物或不同濃度處理細(xì)胞,還能得出藥物或者濃度對(duì)應(yīng)圖,。如果是用藥物濃度梯度處理細(xì)胞,,還能得出DNA損傷的劑量-效應(yīng)關(guān)系圖等。

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