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從零基礎(chǔ)到玩轉(zhuǎn),,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)3分左右的文章方法指南學(xué)起來!

發(fā)布時(shí)間:2024-04-19
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已發(fā)展成為一個(gè)新的交叉學(xué)科,,它將網(wǎng)絡(luò)科學(xué),、生物信息學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和數(shù)學(xué)等學(xué)科的方法結(jié)合到中藥藥理的研究中

傳統(tǒng)中藥歷史悠久,,在治療復(fù)雜慢性疾病方面具有獨(dú)到的療效和較小的毒副作用,。但中藥存在成分復(fù)雜、機(jī)制不清的問題,,阻礙了中藥的現(xiàn)代化和國際化,。中藥的物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)理,尚需應(yīng)用現(xiàn)代醫(yī)學(xué)和生物科學(xué)技術(shù),,進(jìn)行深入的研究,。近年來,將系統(tǒng)生物學(xué)的思想和方法應(yīng)用于中藥研究中,,正成為一種新的趨勢(shì),。中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已發(fā)展成為一個(gè)新的交叉學(xué)科,它將網(wǎng)絡(luò)科學(xué),、生物信息學(xué),、計(jì)算機(jī)科學(xué)和數(shù)學(xué)等學(xué)科的方法結(jié)合到中藥藥理的研究中,從分子水平和分子網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的背景中闡明中藥的作用機(jī)理,。通過中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,,可望使中藥的理論研究和臨床應(yīng)用更加科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn),逐漸得到世界的認(rèn)可,。

 

中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已成為近年來研究的熱點(diǎn)和國家自然基金重點(diǎn)支持的領(lǐng)域,,一系列的數(shù)據(jù)庫及計(jì)算方法被開發(fā)出來。但是,,對(duì)于臨床醫(yī)生,、科研人員和碩博士研究生,尤其是沒有生物信息學(xué)分析基礎(chǔ),、不會(huì)編寫計(jì)算機(jī)程序的初學(xué)者而言,,如何合理地應(yīng)用這些已有的數(shù)據(jù)庫和計(jì)算方法,分析自己所研究的中藥方劑,,解釋實(shí)驗(yàn)結(jié)果,,仍然是一大難題,。本期課程正是為解決此難點(diǎn)而推出:

 

課程特色

導(dǎo)師長期從事中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的資深教授,結(jié)合個(gè)人實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),,帶領(lǐng)廣大學(xué)員,,從科研設(shè)計(jì)、項(xiàng)目具體實(shí)施以及SCI文章發(fā)表等多個(gè)方面,,通過實(shí)際案例,,介紹中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路及具體方法,介紹網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)相關(guān)基金申請(qǐng)及課題設(shè)計(jì),,本課程可以提供電子版的ppt,,會(huì)組建微信群,并把主講教授邀請(qǐng)到微信群解答學(xué)員的疑問,。

 

本次課程以SCI文章為案例主線,,逐一詳細(xì)剖析,全程電腦實(shí)戰(zhàn)教學(xué),。理論與實(shí)踐相結(jié)合,,老師將以最簡單易懂的方式,既介紹中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線,、發(fā)展?fàn)顩r和最新前沿進(jìn)展,又介紹具體的數(shù)據(jù)庫,、工具和軟件的使用,,并在課堂上進(jìn)行上機(jī)指導(dǎo)。本學(xué)習(xí)班全部采用免費(fèi)數(shù)據(jù)庫和在線分析工具,,學(xué)員不需要編寫程序,。帶領(lǐng)大家一步一步完成一篇3分SCI論文的全部分析

 

導(dǎo)師資質(zhì)

生信博士畢業(yè),,從事生物信息學(xué)及中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方面的研究10多年, 是國內(nèi)最早從事網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的資深研究人員,,發(fā)表生物信息學(xué)、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及中藥復(fù)方相關(guān)SCI數(shù)十篇,,含多篇5分以上的文章,,主持多項(xiàng)國家自然基金和省部級(jí)科研課題,獲得多項(xiàng)省部級(jí)科研及教學(xué)獎(jiǎng)項(xiàng),。講課效果好,,獲得學(xué)員廣泛好評(píng)。

 

課程適宜群體

各級(jí)醫(yī)院臨床醫(yī)生,、藥師,、科研單位研究人員、高校老師,、碩/博士研究生,、企業(yè)相關(guān)研發(fā)人員和對(duì)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和生物信息學(xué)感興趣的廣大同行,。同樣適合準(zhǔn)備申請(qǐng)國自然、省自然基金,,希望能夠使用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和生物信息學(xué)的分析手段充實(shí)基金前期研究基礎(chǔ),,提升基金邏輯性和故事性的老師和同學(xué)。(尤其適合初學(xué)者和無基礎(chǔ)的學(xué)員,,無需學(xué)習(xí)任何R語言,,輕松解析中藥復(fù)方/單體的作用機(jī)制,講好故事,,寫好基金,,做好課題,發(fā)好文章)

 

課程安排

中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)內(nèi)容大綱

日期

時(shí)間

題目

課程內(nèi)容

第一天上午

9:00-10:45

中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)簡介

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的發(fā)展歷程和研究現(xiàn)狀簡介

中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)SCI論文的詳細(xì)剖析

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)簡介

中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的核心問題

中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線


12:00-13:30

午餐及午休

第一天下午

13:30-14:00

中藥有效成分的查找

常用中藥數(shù)據(jù)庫及使用方法

14:00-15:30

中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的數(shù)據(jù)來源

化合物結(jié)構(gòu)信息,、靶點(diǎn),、ADME信息查詢

用中藥數(shù)據(jù)庫查詢中藥的成分、靶點(diǎn)

用藥靶數(shù)據(jù)庫查詢化合物靶點(diǎn)

用化合物結(jié)構(gòu)相似性預(yù)測(cè)化合物靶點(diǎn)

基于藥效團(tuán)模型預(yù)測(cè)化合物靶點(diǎn)

用分子對(duì)接驗(yàn)證化合物靶點(diǎn)

15:30-15:45

茶歇

15:45-18:00

疾病相關(guān)基因的查找及獲得

用數(shù)據(jù)庫查詢疾病相關(guān)基因

分析GEO數(shù)據(jù)庫中的基因芯片數(shù)據(jù),,獲取疾病相關(guān)基因


18:00-19:30

晚餐

第一天晚上

19:30-20:40

基于AutoDock Vina軟件分子對(duì)接

軟件安裝

下載小分子配體和蛋白受體的結(jié)構(gòu)文件

準(zhǔn)備配體文件和受體文件

確定對(duì)接區(qū)域(對(duì)接盒子)

建立配置文件及分子對(duì)接

分子對(duì)接結(jié)果輸出

20:40-20:50

休息

20:50-22:00

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析結(jié)果的驗(yàn)證

靶標(biāo)驗(yàn)證

通路驗(yàn)證

藥物效果驗(yàn)證


第二天上午

9:00-10:45

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的實(shí)用技能介紹(一)

基因ID轉(zhuǎn)換

DAVID進(jìn)行GO富集,、通路富集、tissue富集,、疾病基因富集分析,;KEGGMetascape,、MetaboAnalyst  通路分析

Connectivity   Map分析藥物機(jī)制

10:30-10:45



10:45-12:00


基因功能相關(guān)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建


12:00-13:30

午餐及午休


第二天下午

13:30-15:30

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的實(shí)用技能介紹(二)

全基因組網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)獲取

Cytoscape軟件構(gòu)建和分析網(wǎng)絡(luò):網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,;基本拓?fù)涮卣饔?jì)算;重要節(jié)點(diǎn)識(shí)別,;網(wǎng)絡(luò)拓?fù)渲笜?biāo)含義,;模塊分解;子網(wǎng)絡(luò)提??;網(wǎng)絡(luò)可視化;數(shù)據(jù)輸入輸出,;圖形導(dǎo)出,;Cytoscape插件的安裝和使用等

15:30-15:45



15:45-16:30


藥物影響的子網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建、成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),、成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

常用圖形繪制方法介紹

課程總結(jié)及文獻(xiàn)分析

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)課題設(shè)計(jì),、論文撰寫、基金申請(qǐng)介紹

備注:攜帶電腦,,方便跟隨老師進(jìn)行軟件操作,,上課軟件為Cytoscape

另需安裝ZOOM網(wǎng)絡(luò)會(huì)議軟件方可進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)會(huì)議

 

 

上課時(shí)間

時(shí)間:4月2日-3日(2天1夜)

地點(diǎn):線上

 

課程費(fèi)用

3200元/人,;

 

課程優(yōu)惠

1.提前報(bào)名并付款的,,可以預(yù)先拿到學(xué)習(xí)資料,;

2. 三人組團(tuán)報(bào)名,每人優(yōu)惠100元,;

3. 四人組團(tuán)報(bào)名,,每人優(yōu)惠200元;

4. 五人組團(tuán)報(bào)名繳費(fèi),,額外帶一人免費(fèi)注冊(cè)同價(jià)值學(xué)習(xí)班,;

5、可額外繳納500元,,作為復(fù)聽費(fèi)用(復(fù)聽同樣的課程),。


咨詢及報(bào)名方式


TEL:19166210316