您的細(xì)胞做過(guò)STR鑒定嗎?
科研汪們廢寢忘食,、不分晝夜地做實(shí)驗(yàn)搞科研,,數(shù)據(jù)、文章都完美無(wú)瑕,。到最后投稿這一哆嗦,,期刊要求必須出具細(xì)胞株STR鑒定報(bào)告,實(shí)驗(yàn)汪們那時(shí)才意識(shí)到科研竟有如此騷操作~
急急忙忙做鑒定,,結(jié)果竟是其他細(xì)胞(大部分是萬(wàn)惡的Hela細(xì)胞),,此時(shí)才萬(wàn)念俱灰?。?!
什么是細(xì)胞株STR鑒定,?
STR(Short Tandem Repeat)即短串聯(lián)重復(fù)序列,其基因位點(diǎn)是由長(zhǎng)度為3~7個(gè)堿基對(duì)的短串連重復(fù)序列組成,,這些短串聯(lián)重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中,,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細(xì)胞的DNA指紋,。
為什么要做STR鑒定,?
據(jù)統(tǒng)計(jì)約30%細(xì)胞系被交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí),因使用了交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)的細(xì)胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯(cuò)誤,、結(jié)果不可重復(fù),、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果……,這浪費(fèi)大量時(shí)間,、精力和金錢(qián),。因此,科研汪們最好在開(kāi)展課題前提早做細(xì)胞株鑒定,,確定細(xì)胞是否存在問(wèn)題,;而階段性的鑒定也是必須的,因?yàn)榧?xì)胞經(jīng)過(guò)反復(fù)傳代后(5代以上),,突變和交叉污染的幾率極大,。
科研福利來(lái)了~深圳拓普生物提供人源細(xì)胞系STR鑒定服務(wù),,您只需要提供些許樣品,,我們幫您一辨細(xì)胞真假,為您的科研工作提供安全保障,!
細(xì)胞株STR鑒定流程
(1) 首先是提取細(xì)胞的基因組DNA,,提取后需進(jìn)行質(zhì)量鑒定,即OD260/OD280=1.8-2.0,;
(2) 熒光引物PCR擴(kuò)增STR位點(diǎn),;
(3) 擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)過(guò)毛細(xì)管電泳,獲得細(xì)胞基因的分型結(jié)果,;
(4) STR的數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),,比對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)為美國(guó)的ATCC細(xì)胞庫(kù),德國(guó)的DSMZ細(xì)胞庫(kù),,日本的JCRB細(xì)胞庫(kù),;
STR鑒定案例——THP-1細(xì)胞STR鑒定分析
1、細(xì)胞THP-1的STR分型圖譜
2,、STR 位點(diǎn)分型結(jié)果
基因位點(diǎn) | 檢測(cè)樣本數(shù)據(jù) | ATCC數(shù)據(jù) | ||
THP-1 | THP-1 | |||
Amelogenin | X | Y | X | Y |
CSF1PO | 11 | 13 | 11 | 13 |
D13S317 | 13 | 13 | 13 | 13 |
D16S539 | 11 | 12 | 11 | 12 |
D5S818 | 11 | 12 | 11 | 12 |
D7S820 | 10 | 10 | 10 | 10 |
THO1 | 8 | 9.3 | 8 | 9.3 |
TPOX | 8 | 11 | 8 | 11 |
vWA | 16 | 16 | 16 | 16 |
檢測(cè)樣本位點(diǎn)數(shù)據(jù)與ATCC標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)的匹配率為100%
樣品提供:
細(xì)胞懸液(細(xì)胞數(shù)≥106個(gè))或基因組DNA(體積≥20μl,,濃度≥50 ng/μl),。
結(jié)果交付:
STR分型的圖譜和檢測(cè)結(jié)果的書(shū)面報(bào)告。
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文獻(xiàn)引用參考
1.Authentication testing of HEK 293T and HeLa cell lines have been performed by Shanghai Biowing Applied Biotechnology Co.,Ltd via STR profiling. STR profiles match the standards recommended for HEK 293T and HeLa cell lines authentication
2.AGS, NCI-N87, HGC-27 and HEK293 were STR-authenticated on Dec. 8, 2015 by Shanghai Biowing Applied Biotechnology Co. LTD, Shanghai, China