傳統(tǒng)中藥歷史悠久,,在治療復(fù)雜慢性疾病方面具有獨(dú)到的療效和較小的毒副作用,。但中藥存在成分復(fù)雜,、機(jī)制不清的問題,,阻礙了中藥的現(xiàn)代化和國際化。中藥的物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)理,,尚需應(yīng)用現(xiàn)代醫(yī)學(xué)和生物科學(xué)技術(shù),,進(jìn)行深入的研究。近年來,,將系統(tǒng)生物學(xué)的思想和方法應(yīng)用于中藥研究中,,正成為一種新的趨勢。中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已發(fā)展成為一個(gè)新的交叉學(xué)科,,它將網(wǎng)絡(luò)科學(xué),、生物信息學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和數(shù)學(xué)等學(xué)科的方法結(jié)合到中藥藥理的研究中,從分子水平和分子網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的背景中闡明中藥的作用機(jī)理,。通過中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,,可望使中藥的理論研究和臨床應(yīng)用更加科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn),逐漸得到世界的認(rèn)可,。
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已成為近年來研究的熱點(diǎn)和國家自然基金重點(diǎn)支持的領(lǐng)域,,一系列的數(shù)據(jù)庫及計(jì)算方法被開發(fā)出來。但是,,對(duì)于臨床醫(yī)生,、科研人員和碩博士研究生,尤其是沒有生物信息學(xué)分析基礎(chǔ),、不會(huì)編寫計(jì)算機(jī)程序的初學(xué)者而言,,如何合理地應(yīng)用這些已有的數(shù)據(jù)庫和計(jì)算方法,分析自己所研究的中藥方劑,,解釋實(shí)驗(yàn)結(jié)果,,仍然是一大難題。本期課程正是為解決此難點(diǎn)而推出:
課程特色
導(dǎo)師長期從事中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的資深教授,,結(jié)合個(gè)人實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),,帶領(lǐng)廣大學(xué)員,從科研設(shè)計(jì),、項(xiàng)目具體實(shí)施以及SCI文章發(fā)表等多個(gè)方面,通過實(shí)際案例,,介紹中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路及具體方法,,介紹網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)相關(guān)基金申請(qǐng)及課題設(shè)計(jì),本課程可以提供電子版的ppt,,會(huì)組建微信群,,并把主講教授邀請(qǐng)到微信群解答學(xué)員的疑問。
本次課程以SCI文章為案例主線,,逐一詳細(xì)剖析,,全程電腦實(shí)戰(zhàn)教學(xué)。理論與實(shí)踐相結(jié)合,,老師將以最簡單易懂的方式,,既介紹中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線、發(fā)展?fàn)顩r和最新前沿進(jìn)展,,又介紹具體的數(shù)據(jù)庫,、工具和軟件的使用,并在課堂上進(jìn)行上機(jī)指導(dǎo),。本學(xué)習(xí)班全部采用免費(fèi)數(shù)據(jù)庫和在線分析工具,,學(xué)員不需要編寫程序。帶領(lǐng)大家一步一步完成一篇3分SCI論文的全部分析。
導(dǎo)師資質(zhì)
生信博士畢業(yè),,從事生物信息學(xué)及中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方面的研究10多年, 是國內(nèi)最早從事網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的資深研究人員,,發(fā)表生物信息學(xué)、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及中藥復(fù)方相關(guān)SCI數(shù)十篇,,含多篇5分以上的文章,,主持多項(xiàng)國家自然基金和省部級(jí)科研課題,獲得多項(xiàng)省部級(jí)科研及教學(xué)獎(jiǎng)項(xiàng),。講課效果好,,獲得學(xué)員廣泛好評(píng)。
課程適宜群體
各級(jí)醫(yī)院臨床醫(yī)生,、藥師,、科研單位研究人員、高校老師,、碩/博士研究生,、企業(yè)相關(guān)研發(fā)人員和對(duì)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和生物信息學(xué)感興趣的廣大同行。同樣適合準(zhǔn)備申請(qǐng)國自然,、省自然基金,,希望能夠使用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和生物信息學(xué)的分析手段充實(shí)基金前期研究基礎(chǔ),提升基金邏輯性和故事性的老師和同學(xué),。(尤其適合初學(xué)者和無基礎(chǔ)的學(xué)員,,無需學(xué)習(xí)任何R語言,輕松解析中藥復(fù)方/單體的作用機(jī)制,,講好故事,,寫好基金,做好課題,,發(fā)好文章)
課程安排
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)內(nèi)容大綱 | |||
日期 | 時(shí)間 | 題目 | 課程內(nèi)容 |
第一天上午 | 9:00-10:45 | 中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)簡介 | 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的發(fā)展歷程和研究現(xiàn)狀簡介 |
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)SCI論文的詳細(xì)剖析 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | 中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)簡介 | 中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的核心問題 | |
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第一天下午 | 13:30-14:00 | 中藥有效成分的查找 | 常用中藥數(shù)據(jù)庫及使用方法 |
14:00-15:30 | 中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的數(shù)據(jù)來源 | 化合物結(jié)構(gòu)信息,、靶點(diǎn)、ADME信息查詢 | |
用中藥數(shù)據(jù)庫查詢中藥的成分,、靶點(diǎn) | |||
用藥靶數(shù)據(jù)庫查詢化合物靶點(diǎn) | |||
用化合物結(jié)構(gòu)相似性預(yù)測化合物靶點(diǎn) | |||
基于藥效團(tuán)模型預(yù)測化合物靶點(diǎn) | |||
用分子對(duì)接驗(yàn)證化合物靶點(diǎn) | |||
15:30-15:45 | 茶歇 | ||
15:45-18:00 | 疾病相關(guān)基因的查找及獲得 | 用數(shù)據(jù)庫查詢疾病相關(guān)基因 | |
分析GEO數(shù)據(jù)庫中的基因芯片數(shù)據(jù),,獲取疾病相關(guān)基因 | |||
18:00-19:30 | 晚餐 | ||
第一天晚上 | 19:30-20:40 | 基于AutoDock Vina軟件分子對(duì)接 | 軟件安裝 |
下載小分子配體和蛋白受體的結(jié)構(gòu)文件 | |||
準(zhǔn)備配體文件和受體文件 | |||
確定對(duì)接區(qū)域(對(duì)接盒子) | |||
建立配置文件及分子對(duì)接 | |||
分子對(duì)接結(jié)果輸出 | |||
20:40-20:50 | 休息 | ||
20:50-22:00 | 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析結(jié)果的驗(yàn)證 | 靶標(biāo)驗(yàn)證 | |
通路驗(yàn)證 | |||
藥物效果驗(yàn)證 | |||
第二天上午 | 9:00-10:45 | 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的實(shí)用技能介紹(一) | 基因ID轉(zhuǎn)換 |
用DAVID進(jìn)行GO富集、通路富集,、tissue富集,、疾病基因富集分析;KEGG,、Metascape,、MetaboAnalyst 通路分析 | |||
用Connectivity Map分析藥物機(jī)制 | |||
10:30-10:45 | |||
10:45-12:00 | 基因功能相關(guān)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 | ||
基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第二天下午 | 13:30-15:30 | 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的實(shí)用技能介紹(二) | 全基因組網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)獲取 |
Cytoscape軟件構(gòu)建和分析網(wǎng)絡(luò):網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建;基本拓?fù)涮卣饔?jì)算,;重要節(jié)點(diǎn)識(shí)別,;網(wǎng)絡(luò)拓?fù)渲笜?biāo)含義,;模塊分解;子網(wǎng)絡(luò)提??;網(wǎng)絡(luò)可視化;數(shù)據(jù)輸入輸出,;圖形導(dǎo)出,;Cytoscape插件的安裝和使用等 | |||
15:30-15:45 | |||
15:45-16:30 | 藥物影響的子網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建、成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),、成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 | ||
常用圖形繪制方法介紹 | |||
課程總結(jié)及文獻(xiàn)分析 | |||
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)課題設(shè)計(jì),、論文撰寫、基金申請(qǐng)介紹 | |||
備注:攜帶電腦,,方便跟隨老師進(jìn)行軟件操作,,上課軟件為Cytoscape。 | |||
另需安裝ZOOM網(wǎng)絡(luò)會(huì)議軟件方可進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)會(huì)議 |
上課時(shí)間
時(shí)間:4月2日-3日(2天1夜)
地點(diǎn):線上
課程費(fèi)用
3200元/人,;
課程優(yōu)惠
1.提前報(bào)名并付款的,,可以預(yù)先拿到學(xué)習(xí)資料;
2. 三人組團(tuán)報(bào)名,,每人優(yōu)惠100元,;
3. 四人組團(tuán)報(bào)名,每人優(yōu)惠200元,;
4. 五人組團(tuán)報(bào)名繳費(fèi),,額外帶一人免費(fèi)注冊(cè)同價(jià)值學(xué)習(xí)班;
5,、可額外繳納500元,,作為復(fù)聽費(fèi)用(復(fù)聽同樣的課程)。
咨詢及報(bào)名方式
TEL:19166210316