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一文讀懂彗星實驗

Time:2024-04-16
自然界中有很多因素引起DNA損傷,物理因素如冷凍,、放射性照射等,;化學因素包括有機和無機化合物,如過氧化物、各種致癌物等,;生物因素包括年齡,、生活習慣等等。但凡能夠引起真核細胞DNA損傷的,,都能夠用細胞彗星實驗來研究DNA損傷程度,。

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1:DNA損傷示例圖(圖片來自網(wǎng)絡)

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彗星實驗(Comet assay)也被稱為單細胞凝膠電泳實驗(Single cell gel electrophoresis,SCGE),,是一種在單細胞水平上檢測DNA損傷的技術,。

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 真核細胞DNA分子量大,以超螺旋結(jié)構(gòu)存在于細胞核中,。用瓊脂糖凝膠將細胞包埋后,,在細胞裂解液中,細胞膜,、核膜等生物膜結(jié)構(gòu)被破壞,,細胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、RNA及其他成分進入凝膠中,,然后擴散到裂解液中,。但核內(nèi)的DNA仍然纏繞在核骨架上并留在原來的位置。在堿性電泳液中(PH>13,DNA雙鏈解螺旋,,且變性為單鏈,。電泳中,如果DNA沒有損傷,,則將停留在原位,,染色后呈圓形的熒光團,無拖尾出現(xiàn),。如果DNA受損,,斷裂的碎片進入到凝膠中,在電場的作用下,,DNA碎片離開原位向陽極遷移,,形成拖尾。DNA受損越嚴重,,斷裂越多,,產(chǎn)生的碎片就越多、越小,,則向陽極遷移的DNA碎片量就越多,,遷移距離也越長,熒光染色后就能看見彗星樣尾長并且熒光強度增強(彗星樣細胞示意圖如圖2),。通過相應軟件分析如出現(xiàn)的彗尾長度,、彗尾熒光強度等就可以得到該細胞DNA損傷程度,。

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2:彗星樣細胞示意圖

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各實驗室彗星實驗步驟略有不同,本公司所用步驟如圖3,。


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3:彗星實驗步驟

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 彗星實驗染色后拍照,,如果DNA沒有損傷則會看見圓的熒光團,,沒有拖尾,;如果DNA有損傷,則會看見如圖4所示的彗星樣的拖尾,。

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4:彗星實驗染色后拍照

       

在拍照時以tif格式保存圖片,,然后用CASP彗星分析軟件分析。常用的指標包括:尾部DNA百分數(shù),、尾長,、彗星長、尾矩,、Olive尾矩等,,如圖5 

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5:彗星實驗結(jié)果統(tǒng)計

此外,,根據(jù)實驗需求,,和對照組比較還能得到彗星樣細胞形成率或稱細胞彗星率。如果用不同藥物或不同濃度處理細胞,,還能得出藥物或者濃度對應圖,。如果是用藥物濃度梯度處理細胞,還能得出DNA損傷的劑量-效應關系圖等,。

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